A Slovnaf Cup harmadik fordulójában az első ligában szereplő csapatok még alacsonyabb osztályokban játszó csapatok ellen játszottak. A DAC kivételével tovább is léptek.
Eredmények
1. FC Tatran Prešov (II. liga) – FK DAC 1904 Dunajská Streda 1:0 (0:0)
ŠKF Sereď (III. liga) – MFK Košice 1:1 (0:0), a kassaiak büntetőkkel jutottak tovább
FC ViOn Zlaté Moravce – FK Slovan Duslo Šaľa (II. liga) 3:2 (2:0)
FC Spartak Trnava – MFK Tatran Liptovský Mikuláš (II. liga) 3:0 (2:0)
MŠK Rimavská Sobota (II. liga) – FK Senica 1:1 (0:1), büntetőkkel a Senica jutott tovább
MFK Ružomberok – MFK Zemplín Michalovce (II. liga) 0:0, a 11-eseket a Ružomberok nyerte és továbbjutott.
